等高比回来之后发现雷神不见了，便向兄妹两人问清原尾，发现雷公逃脱，不惊失色，大喊一声，“灾难要来临了呀！”于是高比打造了一艘大船，以防止灾难发生，小兄妹两却将牙齿埋在了土壤里面，奇怪的是没过一会却真的发芽了，傍晚时分只见开花结果，第二天长出了一只大葫芦，兄妹两人用锯子锯开葫芦，掏出了葫芦籽，不大不小，正好容得下他们两人。
第三天，只见风云突变，飞沙走石，暴雨从天而降。一时山洪泛滥，淹没了平原、丘陵。高比钻进大船，小兄妹却钻进了葫芦，洪水越长越高，高比驾着大船，一直到达天门。他用手敲天门，敲门声响彻天空，天神害怕了，急性喝令水神退水，顷刻间，雨止风停，洪水一落千丈，大地露了出来。高比的大船从天空跌落在地上，摔得粉碎，高比也牺牲了。
葫芦落在了昆仑山上。昆仑山，即现在甘肃东南部的西秦岭山区，。昆仑山的名称一直向西走，祁连山也曾被说成是昆仑山。兄妹两也从葫芦出来，埋葬了父亲就在一起生活了。大地经历了这次洪水，人类被消灭了，小兄妹两却靠辛勤的劳动，无忧无虑的生活着。
时光飞逝，转眼间他们就长成了大人。他们感到很孤独，因为再没有其他人跟他们说话了，并且他们要是死了，世上就没有了人，那么这么美丽的世界让谁看呢？于是哥哥提出和妹妹结婚，繁衍人类，但妹妹却不同意，说：“我们是亲兄妹，怎么可以结婚呢？”哥哥说：“如果我们不结婚世上就没有我们人类了。”妹妹一想也有道理，但是还想再看看天意如何，就商量向上天占卜，占卜共进行了三次，第一次，兄妹两人在南北山上各点一堆火，如果升在天空中的烟交合在一起，就可以结婚，火着起来后，烟便交合在了一起。第二次兄妹两在南北山上往河谷地带滚石磨盘，到河谷后如果两块磨盘贴合了，就表示可以结婚，结果磨盘也贴合。第三次占卜更像现在的考验，妹妹提出一个问题，说：“我在前面跑，你在后面追，如果追到我咱两就结婚。”于是兄妹两绕树就跑了起来。妹妹机灵敏捷，追了好久总追不到，哥哥智慧过人，他追着追着，猛不防把身一转，气喘吁吁的妹妹就一头撞进了哥哥的怀里再也挣扎不开了。